W XVI wieku ruch reformacyjny prowadzony przez zakonników z Lądu pojawił się w okolicach dzisiejszego Zagórowa.

W latach 1720 – 1817 przybyli ewangelicy ze Śląska, Pomorza, Prus. Zakładali wsie, wznosili kaplice, byli otoczeni opieką duszpasterską przez proboszcza Parafii ewangelickiej we Wrześni.

W latach 1817 – 1856 opiekę sprawowali proboszczowie parafii z Grodźca, Konina, Żychlina. W Zagórowie założono filiał parafii Grodziec.

Parafia w Zagórowie została erygowana w 1856 roku, a konkretnie 24 grudnia. Kilka miesięcy później udało się zakupić plac pod budowę kościoła.

8 maja 1878 roku poświecono kamień węgielny pod kościół, a w 1. Niedzielę Adwentu 1882 roku dokonano poświęcenia kościoła.

W 1913 roku wybudowano kantorówkę, a w 1938 roku plebanię.

Pierwsze nabożeństwo ewangelickie po II wojnie światowej odprawiono 18 lipca 1954 roku. Poprowadził je ks. Karol Świtalski.

17 sierpnia 2008 roku zamontowano w kościele nowy elektroniczny zegar i elektroniczne dzwony.

W kościele regularnie odbywają się nabożeństwa. Kościół w Zagórowie jest kościołem filialnym Parafii Ewangelicko-Augsburskiej w Koninie.